Исследования, направленные на выяснение как материального состава растительных и животных тканей, так и химических процессов, происходящих в организме, осуществлялись и «чистыми» химиками – органиками, и биохимиками, и медиками. У каждой из этих групп специалистов были свои цели.

Химиков-органиков увлекали перспективы синтеза все более сложных веществ путем конструирования их молекул с целью показать возможности искусственного получения аналогов органических соединений, образующихся в живых организмах. Биологи преследовали цели изучения субстратной и функциональной основ живого. Медики стремились выяснить границы между нормой и патологией в организмах. Объединяющим началом всех этих исследований является идея о ведущей роли ферментов и биорегуляторов в процессе жизнедеятельности.

Изучение химизма живой природы происходило в недрах динамической биохимии, предметом которой стали химические процессы, происходящие в живом организме.

Исторические корни динамической биохимии являются довольно глубокими. История изучения брожения – типичный пример исследования живой природы. В нем как в зеркале отразились все трудности и все перипетии проникновения в тайны живого. Надежды Берцелиуса на особые функции катализа в жизнедеятельности организмов, гениальные предвидения Пастера о различии между бесклеточным брожением и ферментативной деятельностью дрожжевых клеток, и, наконец, открытие белковой основы ферментов и их глубокой дифференциации.

Исследование явления брожения явилось программой развития энзимологии (ферментологии), как стержневой области знаний о процессах жизнедеятельности. Эти исследования выявили две противоположные точки зрения на биокатализ вообще. Их условно можно назвать химической и биологической.

Химическая концепция брожения, базирующаяся на успехах препаративного органического синтеза, в тенденции сводила весь биокатализ к обычному химическому катализу.

Несмотря на значительные упрощения в познании действительности, ее заслуги в развитии энзимологии велики. Именно она помогла установить многие положения, прочно вошедшие в современную энзимологию, а именно:

􀀹 аналогию между биокатализом и катализом, между ферментами и катализаторами;

􀀹 положение о наличии в ферментах двух неравноценных компонентов – своего рода активных центров и носителей;

􀀹 заключение о важной роли ионов переходных металлов в активных центрах многих ферментов;

􀀹 вывод о распространении на биокатализ законов химической кинетики;

􀀹 сведение в отдельных случаях биокатализа к катализу неорганическими реагентами (гидролиз крахмала до глюкозы в присутствии серной кислоты).

Биологическая концепция на первых этапах развития энзимологии не имела таких веских экспериментальных доказательств, какие находились под химической концепцией. Самой фундаментальной опорой биологической концепции были труды Пастера, в частности, его прямые наблюдения за деятельностью молочно-кислых бактерий, открытие им маслянокислого брожения и существования анаэробиоза, т. е. способности микроорганизмов получать необходимую им энергию для жизнедеятельности путем брожения.

Открытая Пастером строгая стереоспецифичность живой природы, позволила ему сделать вывод об особом уровне материальной организации ферментов. О достоверности и перспективности идей Пастера свидетельствуют сегодня и химия, и биология. И именно неклассические формы – эволюционный катализ и молекулярная биология.

С одной стороны, получен вывод о том, что состав и структура биополимерных молекул представляют единый стандартизованный набор для всех живых существ, вполне доступный для исследования физическими и химическими методами, что указывает на единство физико–химических законов, управляющих как абиогенными процессами, так и процессами жизнедеятельности.

С другой стороны, была показана исключительная специфичность живого, которая проявляется не только в высоких уровнях организации клетки, но и в поведении фрагментов живых систем на молекулярном уровне, где находят отражение закономерности других уровней.

Специфичность молекулярного уровня живого проявляется в следующем: в существенном различии принципов действия катализаторов и ферментов, в различии механизмов образования полимеров и биополимеров, (их структура определяется генетическим кодом) и, наконец, в совсем не-обычном факте: некоторые реакции окисления-восстановления в клетке «могут происходить без непосредственного контакта между реагирующими молекулами». Это говорит о том, что в живых системах осуществляются такие типы химических превращений, которые не были обнаружены в неживом мире.