Одна из основных предпосылок методов конструирования лекарств — предположение о том, что соединения сходной структуры имеют сходные типы биологической активности. Очень трудно дать строгое определение понятия структурного сходства, о чем свидетельствует обилие и разнообразие параметров, используемых при выводе эмпирических соотношений, связывающих структуру соединений с их биологической активностью. До сих пор наиболее распространенным методом чтения координат и методом построения таких соотношений был регрессионный анализ. Целью этого подхода является построение эмпирических соотношений, связывающих различные сочетания физических, химических или структурных параметров с биологической реакцией соединения. Этот метод особенно эффективен при исследовании не слишком длинных гомологических рядов соединений.

Методам распознавания образов посвящено множество монографий [16]. Этот факт, несомненно, является отражением широкой применимости методов распознавания. Применение методов распознавания образов к химическим задачам началось в середине 1960-х годов в связи с масс-спектральными исследованиями. После этого аналогичные работы стали проводиться во многих других областях химии.

Одна из интересных особенностей этих методов заключается в том, что они могут иметь дело с многомерными данными, т. е. данными, в которых для представления каждого объекта используется более трех параметров. К тому же этими методами можно анализировать данные, полученные из разных источников, а также данные, связи между которыми имеют разрывный характер. При соответствующем подходе методы распознавания образов дают возможность установить критерий отбора из исходного множества данных тех параметров, которые существенны для описания исследуемых свойств. Далее с помощью этого набора наиболее значимых признаков могут быть получены указания о направлении дальнейших исследований.